1. 연구 배경

◦ 국내 소나무재선충병 피해 본수는 ’14년 218만 그루의 최대피해 후 감소 추세를 보였으나, 기후변화(고온현상, 가뭄 등)와 산불피해지 증가로 ’23년 피해가 급증하였으며, 소나무재선충병 발생지역은 줄지 않고 매년 증가하는 추세로 전국적 확산이 우려됨

◦ 산림재난인 소나무재선충병으로부터 경제적·사회적 가치가 높은 소나무를 보호하기 위해 소나무재선충병 내병성 개체 육성과 같은 근본적 해결 방안 마련이 필요함

◦ 이에 국립산림과학원 임목자원연구과에서는 소나무재선충 인공접종을 통한 소나무재선충병 내병성 소나무 선발 연구를 수행하였음

◦ 소나무재선충병 내병성 개체 선발은 소나무재선충 인공접종후에 살아남은 소나무를 선발하는 방식으로 이루어지고 있으나 많은 노동력과 시간이 소요됨

◦ 국립산림과학원 임목자원연구과에서는 소나무재선충병 내병성 관련 분자마커 개발을 통해 내병성 개체 선발의 효율성을 제고하기 위해 ‘소나무재선충병 내병성 바이오마커 개발 및 내병성 개체 증식 기술 개발’ 연구과제를 수행하고 있음.

◦ 소나무재선충병 내병성 개체 선발을 위한 분자마커 개발을 위해서는 고밀도 및 고품질 단일염기다형성(SNP)/삽입·삭제(indel)의 변이염기서열 발굴과 이를 활용하여 대량의 유전형을 효율적으로 분석할 수 있는 유전형 분석용 분자표지 개발이 필요함

◦ 이를 위해서는 소나무재선충병 내병성 소나무 개체의 변이염기서열(SNP/indel)의 탐색이 요구되며, 전체 유전체를 포함하는 변이염기서열의 재현성이 높은 변이염기서열(SNP/indel) 대량 발굴이 요구됨

2. 연구 목적
◦ 거대유전체(약 21Gb)를 가진 소나무 중에서 선발된 소나무재선충병 내병성 개체의 re-sequencing 분석을 통해 고밀도·고품질 SNP 및 indel을 발굴하고 소나무재선충병 내병성 개체 선발을 위한 분자마커 개발에 이용하고자 함


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