□ 주관연구과제명 : 중독유형별 독버섯 4종의 핵유전체 분석 연구

□ 위탁연구과제명 : 독흰갈대버섯의 핵유전체 염기서열 분석 연구

□ 용 역 기 간 : 착수일로부터 ∼ 2021년 10월 20일

 

Ⅰ. 연구목적 및 필요성

◦ 전세계적으로 곰팡이의 분자유전학적 연구 기반 구축을 위한 유전체 분석이 활발히 진행되고 있으나 우리나라는 아직 미흡한 실정임

◦ 유전자원의 접근과 이용하면서 발생하는 이익 공유에 대한 ABS의정서 (일명 나고야의정서)가 발효됨에 따라 국가 자원의 주권 확보 및 관리를 위한 기반 확보 필요

◦ 본 연구는 치명적인 독성물질을 함유한 독버섯인 독흰갈대버섯에 대한 전장 유전체 및 미토콘드리아 유전체 분석을 통하여, 분자 유전학적 연구 기반을 구축하고자 함

 

Ⅱ. 연구수행 방안

◦위탁연구의 과업범위

- 대상 분류군 : 독흰갈대버섯 1종(Chlorophyllum neomastoideum)

- 전장 유전체 및 미토콘드리아 유전체 염기서열 정보 생산 및 분석

◦세부과업 내용

- 전장 유전체 분석용 라이브러리 제작

․ Nanopore 용 Library construction

․ Illumina HiSeq 용 Library construction

- 대용량 염기서열 생산

․ Nanopore (long read) 염기서열 4Gb 생산 (40Mb 기준 100x)

․ Illumina HiSeq (short read) 염기서열 4Gb 생산 (40Mb 기준 100x)

- 데이터 분석

․ 시퀀스 reads quality check

․ Hybrid assemble을 이용한 전장 유전체 조립

․ 기존 곰팡이 정보를 이용한 유전자 예측

․ 미토콘드리아 유전체 유전자 지도 (circular map) 작성

․ 전장 유전체 및 미토콘드리아 관련 microsatellite 등 탐색