연구과제공모
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Information Center for Agriculture and Life Sciences
농업생명과학정보원은 광범위한 농업생명과학분야의 국내외 전문연구정보를 체계적으로 수집, 분석, 가공하여 DB로 구축하고 있고,
대량 생산되는 연구실적들을 정보화하여 온라인으로 유통시킴으로 연구자들이 효율적으로 관련 정보를 얻도록 돕고 있습니다.
유전체 정보를 이용한 특산식물의 분류학적 검토 및 진화역사 구명: 개나리속 식물을 대상으로 한 모델연구
Ⅱ. 제안요청내용
1. 용역명 : 「유전체 정보를 이용한 특산식물의 분류학적 검토 및 진화역사 구명: 개나리속 식물을 대상으로 한 모델연구 (3)」
2. 용역수행기간 : 계약일로부터 2021. 11. 20일까지
3. 용역범위
[1] 특산식물 개나리속의 분류학적 재검토 (3)
ㅇ 공시재료 : 개나리속 식물 (Forsythia)로 개나리, 산개나리, 만리화, 장수만리화 등 한반도 자생 개나리속 식물을 포함하고, 중국, 일본 및 유럽에 자생하는 개나리 및 대표 재배품종을 대상으로 함
ㅇ 처리방법
- 표본조사를 통한 분포확인 및 자생지 정보 확보
(자생지에 대한 생태 및 물리적 환경 정보 제공)
- 전체 대상종에 대한 유전자원 확보 (공시목 후보목 지정)
- 외군을 포함하여, 개나리속의 분류학적 종합연구 추진
※ 종의 재설정을 위한 연구 방법은 자유롭게 제안 가능하며, 유전체 정보 분석을 포함할 것
ㅇ 시험규모 : 개나리속 (비교군으로서 외군 포함할 것)
※ 전세계적으로 10~15종이 알려져 있으며, 정명 인정은 13종
ㅇ 조사항목(포함되어야 할 내용) : 대상종중 1종 이상에 대한 전체게놈(Whole genome) 분석
[2] 유전체 기반 Bigdata를 이용한 특산식물 종분화 및 기원 구명
ㅇ 공시재료 : 한국특산식물 및 주요 분류군
ㅇ 처리방법
- 표본조사를 통한 분포확인 및 현지 자생지 조사
- 분석용 실험재료 수집 및 유전정보 확보 및 분석
- 한국 특산식물의 연대기 분석 및 분자진화 분석
ㅇ 시험규모 : 한국특산식물 8종/년(국립수목원 지정 종)
ㅇ 지정종 : 8종 선택
- 고려공작고사리, 완도호랑가시나무, 지리산오갈피, 긴서어나무, 애기닭의장풀, 푸른마, 애기곡정초, 두메대극, 긴다람쥐꼬리, 백양더부살이, 제주백서향, (검팽나무, 노랑팽나무, 장수팽나무, 중느릅나무 중 택 1), 좀마디거머리말
※ 분석 대상종은 협의에 따라 추가 또는 변경될 수 있음.
ㅇ 조사항목
- 엽록체 DNA 유전체 분석 : 유전체 지도, 구조정보 확보
- 연대기분석 : 근연종과의 분지시기 및 지질학적 연대기 분석
※ 분석대상종별 3개체 × 3지역 × 3유전자
- 분자진화분석 : 염기조성 분석, 염기치환 모델 분석, 계통수 분석, 바이오 마커 제안