연구과제공모

Information Center for Agriculture and Life Sciences

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포플러류 SNP chip 개발_재공고

신청기간
2023/05/25-2023/05/30
지원기관
산림청
Author
관리자
Date
2023-05-18
Views
304
Ⅰ. 개 요

1. 연구용역 배경
◦ 국립산림과학원 임목자원연구과는 기후변화 대응 탄소흡수원 확충을 위해 바이오매스 생산 증진을 위한 속성수 품종 육성 과제를 수행하고 있음

◦ 유전체 분석 기술의 발달과 비용 절감으로 기초 연구가 부족한 임목에 대한 유전체 분석이 가능해짐에 따라 유전체 정보를 활용한 속성수 육종의 효율성을 제고할 필요가 있음

◦ 포플러류를 대상으로 차세대염기서열분석을 활용한 단일염기다형성(SNP) 마커 개발 및 SNP chip 분석 등 대량신속 유전형 분석법의 적용이 필요함.

◦ 따라서 포플러류 SNP chip 개발 및 개체별 유전형 분석을 수행하고 이 결과를 활용하여 기능성 속성수 육성(내건성, 내침수성, 내한성 등) 연구를 하고자 함

◦ 본 사업에서는 기사업을 통해 대량 발굴한 포플러류 SNP 정보를 기반으로 SNP 검증을 통하여 SNP chip 개발을 수행하고자 함.

2. 연구용역 목적
◦ 포플러류 분자 육종을 위한 SNP chip 개발 및 수종별 육종집단 개체의 유전형 분석 검증

Ⅱ. 제안요청내용

1. 용역명 :  포플러류 SNP chip 개발

2. 용역수행기간 : 계약일로부터 2023년 11월 30일까지

3. 용역금액 : 49,500,000원(부가세포함)

4. 과업범위
◦ 공시재료
- 포플러류 선발 및 교배 개체목 대상(총 180본)

◦ 주요 분석내용
- 시료 전처리 및 DNA 시료(국립산림과학원 제공)의 정량 및 정성분석을 실시하여 시료의 실험 적절성 판단
* DNA 시료는 국립산림과학원에서 제공

- 포플러류 DB에서 선발된 유전변이 발굴 및 이의 주변 염기서열을 활용한 프로브 제작

- 제작된 프로브를 활용한 유전형 분석
* 개체의 유전형 분석

5. 주요 산출물
◦ 착수보고서(회)
- 연구용역 계약 후, 연구과제를 수행하기 위한 계획 및 일정 등을 명시한 착수보고서를 계약일로부터 10일 이내에 제출

◦ 중간(정기)보고서(회)
- 연구용역 계약 후 프로젝트를 수행한 중간 보고서를 2023년 8월 15일 이전까지 제출

◦ 완료보고서
- 연구용역 완료 후, 본 연구사업과 관련하여 분석결과, 실험방법 및 연구매뉴얼 등이 포함된 보고서 5부를 제출

◦ D/B 및 기타 제출 자료(외장하드 2 copies)
- 작성된 프로브 염기서열 및 유전형 분석 정보
- 보고서 및 논문 등에 사용할 수 있는 그래프 등의 가공 데이터
- Raw data 및 가공 데이터

◦ 용역기간 중 작성되는 산출물은 별도의 언급이 없는 한 5부 이상 작성하여 보고서와 제출하여야 하며, 제출 자료는 워드프로세서로 작성한 파일을 동시에 제출하고, 인터넷으로 공개가 가능한 형식이어야 한다.

6. 보증기간 및 불량 분석 보상
◦ 품질보증기간 : 1년

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