연구과제공모
iCALS
Information Center for Agriculture and Life Sciences
농업생명과학정보원은 광범위한 농업생명과학분야의 국내외 전문연구정보를 체계적으로 수집, 분석, 가공하여 DB로 구축하고 있고,
대량 생산되는 연구실적들을 정보화하여 온라인으로 유통시킴으로 연구자들이 효율적으로 관련 정보를 얻도록 돕고 있습니다.
분자육종을 위한 포플러류 SNP 발굴
신청기간
지원기관
Author
익명
Date
2022-06-02
Views
97
1. 용역명 : 분자육종을 위한 포플러류 SNP 발굴
2. 용역수행기간 : 계약일부터 2022. 11. 30.
3. 용역금액 : 40,000,000원(부가세포함)
4. 과업범위
◦분석재료
- 공시재료 : 포플러류 70본(사시나무, 은백양, 현사시 등 70클론)
◦주요 분석내용
- 국립산림과학원에서 분리한 포플러류 DNA 수령 및 QC 진행
- 차세대염기서열분석기를 활용한 NGS 데이터 생산 (각 클론당 5Gb 이상의 데이터 생산)
- 포플러류 70본에 대한 염기서열 정보 분석을 통한 SNP 마커 확보 및 관련 DB 구축
* SNP 분석에 활용할 표준유전체 정보는 협의 후 선정
5. 주요 산출물
- 워크시트 작업
* 개체별 SNP 정보 Data sheet
- Raw data 및 가공 데이터 제출(외장하드 제출 및 다운로드 가능한 FTP 주소 제공)
* Sequencing raw data 및 분석 진행시 생산되는 모든 data 포함
