1. 분석용역명 : 소나무 표준 전장 유전체 조립 고도화

 

2. 분석용역 수행기간 : 계약일로부터 2022년 5월 9일까지

 

3. 분석비용 : 110,000,000원(부가세포함)

 

4. 분석용역범위

◦분석용역의 과업범위

- Linked-read NGS 데이터 생산

- 고도화된 조립 분석 결과 산출을 위한 Linked-read 염기서열의 생물정보분석

- 소나무 표준 전장 유전체 조립 데이터 생산

 

◦주요 분석내용

- 공시재료 : 소나무(정이품송)

- Linked-read NGS 데이터 생산

· 소나무의 고품질 DNA 추출 및 품질검정

· 10X Genomics사의 Genome Library Kit을 이용한 DNA 라이브러리 제작

· Illumina 등 NGS 장비를 이용한 DNA 염기서열 데이터 생산 (750G 이상 생산, Q30 85% 이상)

- 고도화된 조립 분석 결과 산출을 위한 Linked-read 염기서열의 생물정보분석

· DNA 염기서열 데이터의 Genome Scaffolding 분석

· Scaffold 매개변수 조정을 통한 최적 분석 결과 도출 및 통계치 기반 결과 평가

- 소나무 표준 전장 유전체 조립 데이터 생산

· 염색체 수준 표준 전장 유전체 데이터 조립

· 기 조립된 전장 유전체와 비교 및 거대 유전체와의 조립 품질 비교

 

5. 주요 산출물

- 염기서열 Raw Data (750G이상)

- 분석 도구별, Scaffolding 조립 분석 매개변수별 통계치 비교 및 Scaffolding 조립 분석 최종 결과

- 최종 결과 보고서 1부.

*워드 프로세서로 작성된 파일 동시 제출