Ⅱ. 제안요청내용

 

1. 용역명 : 소나무재선충병 전파경로 추적을 위한 소나무 재선충 지역 간 계통 분석

 

2. 용역수행기간 : 계약일로부터 2021년 11월 30일까지

 

3. 용역금액 : 금49,841,000원(금사천구백팔십사만일천원)

4. 용역범위

◦ 위탁연구의 과업 범위

- 소나무재선충 표준유전체 및 유전자 재조합 지도 제작

- 전국에서 수집된 지역별 재선충의 개체별 총유전체 서열 결정

- 소나무재선충 변이 자료를 이용한 계통 분석 및 전파경로 추적

◦세부과업 내용

- 소나무재선충 표준유전체 및 유전자 재조합 지도 제작

* 상이한 2개의 한국 소나무재선충 동계교배라인 제작

* 동계교배라인 유전체 및 전사체를 Pacbio 및 Illumina 시퀀싱

* 유전체/전사체 염기서열 자료로 표준유전체 제작 및 유전자 주석 작성

* 2개 동계교배라인 교배를 통한 역교배 자손 생산

* 역교배 자손 100마리의 개체별 총유전체 서열 결정

* 역교배 자손 유전체를 이용한 유전자 재조합 지도 작성

- 전국에서 수집된 지역별 재선충의 개체별 총유전체 서열 결정

* Whole genome amplification을 통한 재선충 개체별 총유전체 서열
결정 프로토콜 확립

* 군집별 3-5마리, 총 300-400마리 이상의 재선충 총유전체 서열 결정

* 한국 소나무재선충 유전자 변이 목록 작성 및 개체별 유전자형 결정

- 소나무재선충 변이 자료를 이용한 계통 분석 및 전파경로 추적

* 유전체 변이 자료 분석을 통한 계통수 작성, 집단 간 분화 정도 측정

* 주성분분석, 군집분석 등을 통한 재선충 집단 구조 확인

* 집단간 유전자 흐름 및 이주 패턴 확인을 통한 전파경로 추적