연구과제공모

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Information Center for Agriculture and Life Sciences

농업생명과학정보원은 광범위한 농업생명과학분야의 국내외 전문연구정보를 체계적으로 수집, 분석, 가공하여 DB로 구축하고 있고,

대량 생산되는 연구실적들을 정보화하여 온라인으로 유통시킴으로 연구자들이 효율적으로 관련 정보를 얻도록 돕고 있습니다.

한국산 장수하늘소 전체 유전체 분석 고도화용역

신청기간
지원기관
Author
익명
Date
2021-01-29
Views
232

□ 주관연구과제명 : 광릉숲의 생태적 수용력을 고려한 장수하늘소 보전 연구


□ 위탁연구과제명 : 한국산 장수하늘소 전체 유전체 분석 고도화


□ 용 역 기 간 : 착수일로부터 ∼ 2021년 10월 20일


 


Ⅰ. 연구목적 및 필요성


◦ 장수하늘소는 대한민국 천연기념물 제218호이자 멸종위기야생생물 I급으로 지정되어 법적으로 보고받고 있는 대한민국 대표 산림 희귀곤충 종임.


◦ 곤충 전체 유전체(whole genome) 분석 결과는 알, 번데기, 유충, 성충 등 생육단계별의 유전자 기능, 생태특성에 관련된 유전학적 특성 파악이 가능하여 종 복원을 위한 유용한 정보를 담고 있음.


◦ 하지만, 현재 세계적으로 총 138종의 곤충 종에 대한 전체 유전체가 분석되어 있으며, 이 중 딱정벌레목에 속하는 곤충은 8종(하늘소과 1종)에 불과함.


◦ 본 주관과제(광릉숲의 생태적 수용력을 고려한 장수하늘소 보전 연구)의 궁극적인 연구 목표인 “장수하늘소 종 보전”을 위하여 장수하늘소의 유전학적 특성 이해가 필수적이며, 국립수목원내에 곤충 유전체 전공자가 없고 현재까지 확보한 자료의 분석과 깊이 있는 전체 유전체 분석의 고도화를 위하여 위탁연구과제를 추진할 필요성이 있음.


 


Ⅱ. 연구수행 방안


◦위탁연구의 과업범위


- 대상 분류군 : 국내(광릉숲 포함)·외 장수하늘소 개체


 


◦세부과업 내용


- 장수하늘소 전체 유전체의 고품질/고도화 염기서열 분석


․ Hi-C sequencing을 이용한 염색체 수준의 유전체 염기서열(Chromosome- Level Genome Sequence) 분석


- 장수하늘소 SSR (simle sequence repeat) 표지(marker) 개발(5~10개)


․ 초위성체(microsatellite) 표지 개발을 위한 NGS 분석


․ 단편 분석(Fragment analysis)


․ QDD 프로그램을 이용한 초위성체 영역 탐색


․ 5~10개의 유효한 다양성이 높은 마커 탐색 및 확보


 


- 장수하늘소 비교 유전체 분석 완료


․ 기 보고된 하늘소 전체 유전체 정보와 장수하늘소 전체 염기서열을 이용한 비교 유전체 분석